В 2047 году инопланетное вторжение сократило население Земли вдвое, а контратаки сил самообороны почти не приносят результата. Последняя надежда человечества связана с секретной операцией «План Зет», разработанной на японской военной базе. Главный герой, Хироши Акедзима, должен проникнуть в самое сердце вражеской территории, чтобы выполнить эту миссию и остановить захватчиков.