Десять лет назад Кодзи Кабуто на своём суперроботе Мадзингер Зэд и его друзья из лаборатории фотонной энергии одержали победу над зловещим доктором Хеллом, спася человечество. Теперь Кодзи, как когда-то его отец и дед, посвятил себя науке. Во время исследований под горой Фудзи он обнаруживает нечто невероятное — древнюю и неизвестную форму жизни. Это открытие грозит миру новой опасностью, и будущее вновь оказывается в руках легендарного пилота и его непобедимого железного защитника.