Перезапуск легендарной франшизы, который подробно раскрывает события первого эпизода сериала. Юный гений-сыщик Синъити Куду, расследуя подозрительное дело, попадает в руки преступной организации. В результате он принимает экспериментальный яд, который превращает его в ребёнка, сохранив острый ум взрослого. Теперь, скрываясь под именем Конан Эдогава и живя у своего друга детства Ран Мори и её отца-детектива, он продолжает расследовать запутанные преступления, параллельно пытаясь выйти на след зловещей организации и найти противоядие.