В альтернативной Японии XIX века царит странный технологический уклад: гейши играют на электрогитарах, а самураи в обтягивающих костюмах используют огнестрельное оружие. Именно так действует тайный отряд «Самурай Ган», члены которого — пацифист Итимацу, доблестный Дэймон и прекрасная Курэнай — с самурайской решимостью борются с преступностью и произволом. Однако их методы скоро навлекают на головы героев гнев властей, создающих специальное подразделение для расправы над этими неудобными правдолюбцами.