Вместе с гениальным учёным Эйтиро Кусимой талантливый дайвер Масамити Хару участвовал в проекте по строительству подводного города. Во время исследования океанских аномалий Хару получил тяжёлые ранения и впал в кому, пробудившись лишь полвека спустя. Теперь под водой раскинулся огромный город Искусственного Острова, а люди общаются через киберпространство Мета-Реал, вживляя себе специальные чипы. Кусима, продолжающий свои исследования, вновь зовёт на помощь Хару, прикованного к инвалидному креслу. Чтобы раскрыть тайну давней трагедии и истинный потенциал виртуального океана, бывший дайвер погружается в цифровую пучину, где его поддерживает обычная школьница Аой Минамо.