Год назад Ринтаро Окабэ ценой невероятных усилий стабилизировал мировую линию, спася всех своих друзей. Но бесчисленные прыжки во времени, которые ему пришлось совершить, не прошли бесследно — накопленные побочные эффекты привели к тому, что сам Ринтаро исчез из реальности. Теперь о нём помнит лишь его девушка, гениальный физик Макисэ Курсу. Осознав, что произошло, она использует все свои знания и начинает отчаянные поиски способа вернуть потерянного возлюбленного.