Гениальный, но вечно неудачливый суперзлодей Мегамозг годами безуспешно пытается завоевать Метро-Сити, и каждый раз его планы рушит непобедимый супергерой Метро-Мэн. Неожиданно устранив своего заклятого врага, Мегамозг понимает, что жизнь без противника потеряла смысл. Чтобы вернуть цель, он создаёт нового защитника — Титана. Однако его творение быстро находит злодеяние куда более увлекательным и решает не править миром, а уничтожить его. Теперь Мегамозгу предстоит сделать нелёгкий выбор и самому встать на путь героя, чтобы спасти город от собственного детища.