Семнадцатилетний гений-детектив Синъити Кудо стал жертвой таинственного преступного синдиката: ему дали экспериментальный яд, который превратил его в семилетнего мальчика. Чтобы скрыть свою личность и защитить близких, он принимает имя Конан Эдогава и селится в доме своей подруги детства Ран Мори. Используя острый ум и помощь друзей, Конан расследует запутанные преступления, пытаясь выйти на след зловещей организации и найти противоядие, всё время скрывая правду от тех, кто ему дорог.