После десятого столкновения с NOVA организация «Шевалье» столкнулась с серьёзной проблемой: угроза появляется всё чаще, а потери среди Пандор превышают возможности по подготовке новых бойцов. В качестве решения запускается «Проект E-Пандора», наделяющий обычных людей силами Пандор. Для демонстрации проекта в Аляскинскую базу приглашены Пандоры со всего мира, включая Сателлайзер, Кадую и Рану. Однако чем дальше, тем больше странностей обнаруживается в новом проекте, вызывая растущее беспокойство у прибывших девушек.