Иммигрант Хамато Йоши приобрёл четырёх маленьких черепашек, но случайная мутация изменила всё: сам он превратился в крысочеловека Сплинтера, а его питомцы стали огромными разумными существами. Сплинтер воспитал их как сыновей в подземных коллекторах Нью-Йорка, обучив философии и боевым искусствам ниндзя. Теперь, пятнадцать лет спустя, Леонардо, Донателло, Рафаэль и Микеланджело выходят на улицы города, готовые сразиться с любыми угрозами и найти самую вкусную пиццу на свете.