Старшеклассник Кей Кусанаги, проводя ночь у озера, наблюдает невероятное явление: из водяной воронки на берег материализуется высокая женщина в странном чёрном костюме. Каково же было его удивление, когда на следующий день эта самая женщина, Мидзухо Кадзами, появилась в его школе в качестве новой учительницы и классного руководителя. А по возвращении домой Кея ждал ещё один сюрприз — загадочная инопланетянка оказалась его соседкой.