После смерти приёмного отца юный Сиро Эмия живёт один в огромном поместье. Доброго и хозяйственного шестнадцатилетнего парня опекают школьная подруга Сакура Мато и его учительница (а по сути — старшая сестра) Тайга Фудзимура. Спокойная жизнь рушится, когда Сиро узнаёт, что их город Фуюки является ареной магической войны за Святой Грааль, повторяющейся раз в несколько поколений. Однако цикл ускорился: с прошлой битвы прошло лишь десять лет, и новая схватка уже начинается.