Спустя годы после последних событий Даисукэ и его друзья, повзрослев, пытаются совместить повседневную жизнь с заботами о своих партнёрах-дигимонах. Их привычный порядок нарушает появление таинственного Руи Овады, который заявляет, что именно он был первым в мире человеком, заключившим союз с цифровым существом. Это неожиданное открытие ставит под вопрос всё, что известно героям о связи двух миров, и заставляет их вновь объединиться для раскрытия новой тайны.