Фильм состоит из двух историй. В первой у Пино́ко начинаются периодические боли, похожие на сердечный приступ, но обследования не находят причин. В это время Блэк Джек получает срочный вызов от пациентки, чья личность его шокирует: это Юриэ Сайондзи, из чьей тератогенной кистомы он десять лет назад создал Пино́ко. Во второй части легендарного хирурга похищает правительство разорённой войной страны.