Мирный городок Ретровилль подвергается неожиданному нападению: пришельцы похищают всех родителей, пока дети развлекаются в парке. Первые дни свободы от взрослых правил быстро сменяются тоской, и юный гений Джимми Нейтрон решает действовать. Вместе со своим киберпсом он конструирует флотилию космических кораблей, чтобы вместе с другими ребятами отправиться в опасное межгалактическое путешествие и вызволить своих мам и пап из инопланетного плена.