В ходе археологических раскопок профессор Даиба по неосторожности выпускает на свободу древнее и беспощадное зло, угрожающее стереть с лица земли всё живое. Единственной силой, способной противостоять всепоглощающей тьме, становятся бесстрашный капитан Харлок и его верная команда космических пиратов. На кону — судьба всей Вселенной, и в эпической схватке решается, уцелеет ли галактика или будет повергнута в хаос.