После высылки на Юкон за потерю доверия руководства во времена Холодной войны суперагент Ник Фьюри возвращается, чтобы предотвратить уничтожение Америки. Ему предстоит внедриться в международную террористическую организацию, которая при поддержке «Гидры» создала смертоносный вирус. Фьюри должен найти противоядие и остановить распространение чудовищной эпидемии.