В мире, где высокие технологии пронизывают всю жизнь, а интернет стал неотъемлемой частью реальности, люди общаются с искусственным интеллектом — своими цифровыми ассистентами Net Navi. Эти сущности живут в специальных устройствах PET и помогают пользователям как в киберпространстве, так и за его пределами. Их основная задача — борьба с вирусами и хакерами на службе у преступных группировок. Пятиклассник Хикари Нэтто получает своего первого Net Navi по имени Мегамен, и вместе они становятся грозной командой в сетевых сражениях. Вскоре к ним присоединяются друзья, чтобы противостоять могущественной теневой организации.