Семнадцатилетний Куро Кумогакурэ кажется обычным бездельником, дни напролёт просиживающим в своей обветшалой квартире и ворующим пиво у соседа. Однако его неприметность — всего лишь прикрытие. На самом деле он ниндзя на службе у секретного правительственного агентства, регулярно выполняющий крайне опасные миссии. Новая задача ставит перед ним необычную цель: под видом обычного старшеклассника внедриться в школу, где ему предстоит совмещать будни ученика с теневой работой профессионального убийцы.