Много лет спустя после событий первой части журналист Стенли Маус отправляется в Африку на поиски легендарного древнего племени котов. Его находка оборачивается новой угрозой для всей мышиной цивилизации. И вновь на передовой оказывается специальный агент Ник Грабовский, которому предстоит вступить в схватку с коварным противником и спасти мир от надвигающегося кошачьего апокалипсиса.