В 1945 году, через шесть лет после вторжения инопланетных сил Нейрой, Йошика Мияфуджи, лишившаяся магических способностей, пытается начать новую жизнь и учится на врача. Но её планы нарушает курсант Имперского флота Шизука Хаттори, сообщив, что Йошику ожидает возвращение для продолжения обучения за границей. Действие франшизы разворачивается в альтернативной реальности, где Вторая мировая война не началась, но Земля оказалась под угрозой могущественных инопланетян. Против них эффективны лишь юные ведьмы, способные совмещать магию с передовыми технологиями в специальных боевых комплектах.