Жизнь четырнадцатилетней Мадоки Канамэ была обычной и размеренной, пока ей не начал сниться странный сон. В нём тёмноволосая девочка сражалась со злом в причудливом фантасмагорическом мире. Каково же было удивление Мадоки, когда она встретила эту самую девочку — Хомуру Акэми — в своей школе. Та сразу предупредила её не вмешиваться в чужие дела. Однако спокойно наблюдать со стороны Мадока не может, особенно когда на её глазах гибнет милое существо, а привычная реальность начинает рушиться, открывая путь тёмным силам.